崇川区与南通港主港区及南通集装箱码头仅一路之隔。南通港是中国十大海港之一，是万吨巨轮驶入长江后的长江北岸的第一个可停靠的“江中海港”，是长江水上中转的重要枢纽和物资集散地，最大靠泊能力为5万吨。由长江溯流而上，可达上游七省（市）；由长江顺流而下，出江入海，可达中国沿海各省市，并通航世界65个国家和地区的178个港口。