南通火车站位于崇川区以北的港闸区站前二号路。宁启铁路位于江苏省中部，是国家“八纵八横”铁路主通道之一的组成部分。南通铁路正在加紧建设中，它向北经徐州、向南经上海与全国铁路网相连。南通铁路港口专线穿过开发区，并将在开发区内设港前站。